Лаборатория лесной геномики

1. Впервые было осуществлено полное описание, филогенетическое изучение и тестирование на разных средах гриба-трутовика Porodaedalea niemela, обитающего на самой северной границе бореальных лесов на полуострове Таймыр, а также впервые был секвенирован и аннотирован геном данного гриба (К. Крутовский - руководитель геномного проекта данного гриба совместно с Объединённым Геномным Институтом Министерства энергетики США).
   
2. На основе полногеномных данных, полученных в проектах К. Крутовского были разработаны новые полиморфные маркёры для популяционно-генетических, филогенетических и геногеографических исследований сосны обыкновенной, сосны сибирской кедровой и лиственницы сибирской.
   
3. Впервые на стыке дендрохронологии и геномики изучена с использованием полногеномных маркёров связь динамики скорости и стабильности индивидуального роста с индивидуальной гетерозиготностью у горной тсуги и лиственницы сибирской и показана большая нестабильность роста у быстрорастущих деревьев.
   
4. Впервые был секвенирован и аннотирован геном серого кита и проведён анализ генов предположительно связанных с высокой продолжительностью жизни данного вида.
   
5. Впервые секвенированы и аннотированы ядерные, митохондриальные и хлоропластные геномы важнейших древесных видов бореальных лесов Сибири – сибирской лиственниц и кедра (К. Крутовский - рук. геномного проекта, поддержанного мегагрантом Правительства РФ) а также хлоропластный геном карельской берёзы.
   
6. Впервые полностью просеквенирован и собран митохондриальный геном шерстистого мамонта.
   
7. Впервые изучены мобильные генетические элементы в митохондриальном геноме четырёх видов опят.
   
8. Впервые полностью секвенирован, собран и аннотирован геном бореального опёнка Armillaria borealis.
   

Внедрение результатов исследования:

• Разработан, запатентован и внедрён новый метод сборки больших геномов.

• Получен и проаннотирован геном лиственницы, который используется как референсный геном в полногеномных ассоциативных исследованиях и геномной селекции.

Образование и переподготовка кадров:

• Создана новая кафедра геномики и биоинфораматики СФУ.

• Разработана магистерская и аспирантская программы кафедры геномики и биоинфораматики СФУ.

• Разработаны новые курсы по биоинформатике, молекулярной экологии и геномики.

Организационные и инфраструктурные преобразования:

Создан Научно-образовательный центр геномных исследований Института фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета, (г. Красноярск) с перспективой создания на его основе ЦКП геномных исследований.

Другие результаты:

Лаборатория участвует в разработке первого отечественного секвенатора ДНК третьего поколения, осуществляемого стартапом «ГАММА-ДНК» получившем грант фонда «Сколково». Руководитель лаборатории К. В. Крутовский является одним из 6 авторов оригинального метода секвенирования, получившего международный патент и одним из 9 участников проекта.

Сотрудничество:

• Осуществляется тесное сотрудничество и совместные исследования с Институтом общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, Воронежским государственным лесотехническим университетом им. Г. Ф. Морозова, Филиалом Института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, Институтом леса им. В.Н.Сукачёва СО РАН, Российским центром защиты леса и Центром защиты леса Красноярского края.

• Осуществляется международное сотрудничество и совместные исследования с Гёттингенским университетом и Институтом лесной генетики в Германии.

• Участие в проектах международного консорциума по альпийской лесной геномике (AforGeN) и эволюционной лесной генетике (EvolTree).