Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Номер договора
14.W03.31.0012
Период реализации проекта
2017-2021
Заведующий лабораторией

По данным на 01.11.2022

13
Количество специалистов
30
научных публикаций
Общая информация

Основное направление исследований ученых лаборатории – изучение возрастных изменений в живых организмах на молекулярном и клеточном уровне, с особым вниманием к механизмам поддержания протеастаза и регуляции биосинтеза белка. Возраст является одним из главных факторов риска таких болезней человека, как рак, диабет, болезни сердца и многие другие. Нарушения белкового синтеза вносят большой вклад в старение клеток и всего организма в целом. Методы системной биологии позволяют в одном эксперименте оценить количественные изменения экспрессии генов в клетках и тканях в масштабе всего генома. Лаборатория исследует прижизненные картины биосинтеза белков в разных органах молодых и пожилых животных в зависимости от различных факторов. Комбинация экспериментальных моделей и биоинформатики даёт возможность выявить молекулярные маркёры старения и найти клеточные мишени для борьбы с ним и сопутствующими ему заболеваниями.

Название проекта: Белковый синтез в старении и контроле продолжительности жизни

Цели и задачи

Направления исследований:

  • Изучение возрастных изменений в живых организмах на молекулярном и клеточном уровнях, с особым вниманием к механизмам поддержания протеостаза и регуляции биосинтеза белка

  • Изучение причин изменения смертности
  • Сравнительная и эволюционная геномика
  • Изучение изменений маркёров старения при клеточном репрограммировании

Цель проекта: Анализ биосинтеза белка на системном уровне в органах и тканях животных, определение его изменений в зависимости от диеты, использования лекарств и других особенностей


Практическое значение исследования

Научные результаты:

  1. С использованием метода рибосомного профайлинга описаны изменения в биосинтезе белка в печени и почках мышей при старении. 
  2. Разработано программное средство визуализации данных рибосомного профалинга svist4get. 
  3. Разработана модель, объясняющая сложную динамику смертности в человеческой популяции как результирующую между уменьшающейся детской смертностью, связанной с отбором, и нарастающей смертностью из-за старения, которое начинается ещё до рождения. 
  4. Выявлены сигнатуры транскрипционных изменений, происходящих в органах мышей при продлевающих жизнь интервенциях. 
  5. Определены изменения, происходящие в органах мышей при деплеции трансляционного фактора eEF2 (замедлении трансляции). 
  6. На дрожжевой модели показано, что замена гена нокаутирующей кассетой может приводить к аберрантным изменениям уровня экспрессии соседних генов по механизму, связанному с регуляцией трансляции. 
  7. Показано, что циклическая индукция транскрипционного фактора FOXM1 в мышах задерживает развитие естественного и прогероидного старения и продлевает продолжительность жизни.

Образование и переподготовка кадров:

  • Защиты: 3 кандидатские диссертации, 2 докторские диссертации.

  • Разработаны 4 курса лекций.

  • Проведены 5 курсов лекций и практикумов.

  • Количество студентов, защитивших квалификационные работы в лаборатории за всё время существования: 15.

  • Количество аспирантов, работавших в лаборатории за всё время: 8.

Организационные и инфраструктурные преобразования:

Налажена работа и обслуживание приборов общего пользования:
  • проточный цитофлуориметр MACS Quant.
  • мультимодальный планшетный ридер CLARIOstar.

Сотрудничество:

  • Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School: совместные проекты, статьи, стажировка сотрудника лаборатории.
  • Сколковский институт науки и технологий: совместный научный проект.

Скрыть Показать полностью
Anisimova AS, Alexandrov AI, Makarova NE, Gladyshev VN, Dmitriev SE.
Protein synthesis and quality control in aging. Aging (Albany NY). 2018, 10(12): 4269-4288.
Galkin F, Zhang B, Dmitriev SE, Gladyshev VN.
Reversibility of irreversible aging. Ageing Res Rev. 2019, 49: 104-114.
Young DJ, Makeeva DS, Zhang F, Anisimova AS, Stolboushkina EA, Ghobakhlou F, Shatsky IN, Dmitriev SE, Hinnebusch AG, Guydosh NR.
Tma64/eIF2D, Tma20/MCT-1, and Tma22/DENR Recycle Post-termination 40S Subunits In Vivo. Mol Cell. 2018, 71(5): 761-774.e5.
Tyshkovskiy A, Bozaykut P, Borodinova AA, Gerashchenko MV, Ables GP, Garratt M, Khaitovich P, Clish CB, Miller RA, Gladyshev VN.
Identification and Application of Gene Expression Signatures Associated with Lifespan Extension. Cell Metab. 2019, 30(3): 573-593.e8.
Kinzina ED, Podolskiy DI, Dmitriev SE, Gladyshev VN.
Patterns of Aging Biomarkers, Mortality, and Damaging Mutations Illuminate the Beginning of Aging and Causes of Early-Life Mortality. Cell Rep. 2019 29(13):4276-4284.e3.
Gerashchenko MV, Nesterchuk MV, Smekalova EM, Paulo JA, Kowalski PS, Akulich KA, Bogorad R, Dmitriev SE, Gygi S, Zatsepin T, Anderson DG, Gladyshev VN, Koteliansky VE
Translation elongation factor 2 depletion by siRNA in mouse liver leads to mTOR-independent translational upregulation of ribosomal protein genes. Sci Rep. 2020 10(1):15473
Anisimova AS, Meerson MB, Gerashchenko MV, Kulakovskiy IV, Dmitriev SE, Gladyshev VN.
Multifaceted deregulation of gene expression and protein synthesis with age. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 117(27):15581-15590.
Egorov AA, Alexandrov AI, Urakov VN, Makeeva DS, Edakin RO, Kushchenko AS, Gladyshev VN, Kulakovskiy IV, Dmitriev SE.
A standard knockout procedure alters expression of adjacent loci at the translational level. Nucleic Acids Res. 2021, 49 (19), 11134-11144.
Ribeiro, R., Macedo, J.C., Costa, M. Ustiyan V., Shindyapina A.V., Tyshkovskiy A., Gomes R.N., Castro J.P., Kalin T.V., Vasques-Nóvoa F., Nascimento D.S., Dmitriev S.E, Gladyshev V.N., Kalinichenko V.V., Logarinhoet E.
In vivo cyclic induction of the FOXM1 transcription factor delays natural and progeroid aging phenotypes and extends healthspan. Nat Aging 2022, 2, 397–411.
Медиа
Вторник , 03.12.2019
Воскресенье , 30.09.2018
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Центр интегративной структурной биологии (10)

НИЦ «Курчатовский институт» - (Курчатовский институт)

Биология

Москва

Юсупов Марат Миратович

Россия, Франция

2024-2028

Лаборатория эволюционной трофологии

Институт проблем экологии и эволюции им. А. Н. Северцова РАН - (ИПЭЭ РАН)

Биология

Москва

Энрике Жизберт Касас

Испания

2022-2024

Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики

Уфимский федеральный исследовательский центр РАН - (УФИЦ РАН)

Биология

Уфа

Прокопенко Инга Анатольевна

Великобритания

2021-2023