Лаборатория геномных и пост-геномных технологий в животноводстве (10)

Научные результаты:

В 2024 году в рамках реализации научного проекта сотрудниками лаборатории геномных и пост-геномных технологий в животноводстве совместно с индустриальным партнером проекта (ГК "Таврос") начато создание биобанка племенных животных.
В 2024 году проведен сбор биоматериалов, выделение ДНК и РНК у более 2200 свиней пород дюрок, ландрас и йоркшир. Создание подобной коллекции биоматериалов племенных свиней имеет большое научное и прикладное значение, не только позволяя сохранять информацию о генетическом разнообразии пород, но и внося значительный вклад в быстрое внедрении геномной селекции.
Для поиска генетических маркеров хозяйственно-полезных признаков выполнен полногеномный анализ ассоциации у 7985 племенных свиней трех пород. Идентифицированы генетические локусы, связанные с репродуктивными признаками (среднее количество рожденных поросят, среднее количество живорожденных, доля мертворожденных, средний вес гнезда и др.), продуктивными признаками (толщина шпика, глубина мышечного глазка) и откормочными качествами свиней (средняя длина туловища, обхват пясти).
Создана первая версия каталога значимых генетических локусов, ассоциированных с хозяйственно-ценными признаками у свиней пород йоркшир, дюрок и ландрас. На текущий момент каталог содержит систематизированную информацию о 402 значимых ассоциациях с 15 хозяйственно-полезными признаками. Совместно с индустриальным партнером прорабатываются пилотные программы по использованию результатов исследований в селекционной программа ГК Таврос.
Проведена функциональная аннотация ассоциированных с изучаемыми признаками генетических локусов с использованием доступных баз данных. Обнаружены локусы, связанные с развитием нескольких ключевых признаков. Например, с продуктивными качествами (средним весом поросёнка при рождении, средним количеством рожденных поросят, долей живорожденных поросят) с наиболее высоким уровнем значимости ассоциирован локус в гене транспортного белка кинезина 1 TRAK1 (rs80952748).
Выполнен анализ ассоциации казуальных (причинных) мутаций и полиморфных вариантов, связанных с заболеваниями и хозяйственно-полезными признаками у свиней пород йоркшир, ландрас и дюрок на исследуемой выборке.
В рамках стажировки членов коллектива проекта (студентов, аспирантов) в Казанском федеральном университете по теме «Базовые принципы и навыки гистологической техники» проведено исследование морфологии дефектных (кратерных) сосков свиней по сравнению со здоровыми проводилось
Проведен обзор современной литературы по актуальным направлениям исследований в области свиноводства, обозначенным индустриальным партнером, среди которых хромота свиней, агрессивное поведение и каннибализм, врожденные пороки развития поросят, инфекционные заболевания свиней и др., а также методам их решения, включая геномное редактирование и внедрение современных методов идентификации животных на производстве.
Результаты работ за 2024 год представлены в виде устных докладов руководителя и исполнителей проекта на 5 научных мероприятиях Всероссийского и международного уровня, 2 из которых были организованы в рамках проекта.
Все поставленные задачи за первый год проекта успешно выполнены, полученные результаты служат основой для эффективного выполнения и дальнейшего развития проекта в последующие годы.
Работы 2024 года стали важным шагом в создании современной научной инфраструктуры, которая позволит российским исследователям участвовать в международных коллаборациях и развивать передовые технологии. Лаборатория продолжает совершенствовать вычислительные методы, моделирование физических процессов и аппаратные решения, оставаясь на переднем крае науки.