Лаборатория геномных и пост-геномных технологий в животноводстве (10)

Цель проекта:

1. Исследование генома и транскриптома племенных свиней пород ландрас, йоркшир и дюрок для идентификации новых генетических маркеров хозяйственно-ценных признаков животных и разработки эффективных постгеномных подходов направленной селекции, генетической паспортизации и получения линий с новыми характеристиками.
2. Создание в Республике Башкортостан научной школы по геномным и пост-геномным исследованиям в области животноводства

Задачи проекта:

1. Создание биобанка ДНК и РНК тканей племенных животных с целевыми признаками.
2. Поиск информативных биомаркеров, ассоциированных с устойчивостью и подверженностью экономически значимым заболеваниям и хозяйственно-ценными признаками, с использованием методов GWAS, секвенирования генома и транскриптома.
3. Выявление генов, задействованных в формировании хозяйственно-ценных признаков животных, с использованием комбинированных полногеномных и транскриптомных исследований.
4. Разработка подходов к усовершенствованию хозяйственных признаков животных с применением методов генной инженерии и геномного редактирования.
5. Разработка комплементарных классической геномной селекции подходов отбора животных по пост-геномным данным, включая биохимические, протеомные и транскриптомные маркеры и аллели, напрямую связанные с контролем генетической экспрессии.
6. Развитие новой цифровой платформы SwineTSS_Russia, представляющей собой совокупность мультиомиксных данных: генетических цифровых атласов экспрессии генов, аллель-специфичной экспрессии и активности регуляторных элементов генома, связанных с полезными признаками свиней.
7. Ретроспективный анализ баз метаданных по фенотипам и другим характеристикам свиней для выделения и последующего геномного и постгеномного анализа наиболее контрастных по признакам животных для выделения генетических основ фенотипических проявлений.
8. Подготовка образовательных программ и проведение стажировок для обучения молодых специалистов современным методам направленной селекции, транскриптомного анализа и геномного редактирования.